La Loi d'orientation agricole de 1999 confère cinq grandes missions à l'enseignement professionnel agricole.

• La première consiste à assurer une formation générale, technologique et professionnelle initiale et continue à ses élèves, apprentis et stagiaires.
• La deuxième concerne l'animation du milieu rural et le développement du territoire.
• Par ailleurs, l'enseignement agricole doit contribuer à l'insertion scolaire, sociale et professionnelle des jeunes et des adultes.
• Il s'engage également à participer à des activités de développement, d'expérimentation et de recherche appliquée.
• Enfin, il se doit de s'impliquer dans des actions de coopération internationale, notamment en favorisant les échanges et l'accueil d'élèves, apprentis, étudiants, stagiaires et enseignants. 

En assurant de façon indissociable formation générale, formation technologique et professionnelle, l'EPLEFPA  contribue ainsi au développement personnel des jeunes et des adultes, à l'élévation de leurs qualifications ainsi qu'à leur insertion sociale et professionnelle.